More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3354 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  54.71 
 
 		 278 aa  325  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  52.71 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1120  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.429709 
 
 
-
 
NC_002950  PG1010  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.784964 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0586  ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.559058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  32.83 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.8 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  31.07 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  27.31 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  30.28 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  31.31 
 
 		 226 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.9 
 
 		 302 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  29.92 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  29.3 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  29.47 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  28.84 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  31.68 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  33.02 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  35.12 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  30.96 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  32.99 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  33.5 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  34.16 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  29.55 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  29.9 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  31.12 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 232 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  32.34 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  27.98 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  27.57 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  27.98 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  31.34 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  28.44 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  27.4 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.24 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  28.51 
 
 		 313 aa  108  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  28.44 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  27.44 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  29.82 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  27.43 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  30.49 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  26.92 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  30.48 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  28.28 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  28.28 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  29.44 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  26.19 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  27.09 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  26.46 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  30.37 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  26.19 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  27.1 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  28.51 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  28.71 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  26.19 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  27.52 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  27.56 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  24.12 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  29.82 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  26.82 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  29.44 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.44 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  29.44 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  27.98 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  27.98 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  25.67 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  25.1 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  28.21 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  28.44 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  27.09 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  27.44 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  30 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>