More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1280 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  95.53 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  70.79 
 
 
291 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  68.07 
 
 
296 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  58.21 
 
 
291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 
283 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 
283 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
285 aa  285  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 
277 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  40.29 
 
 
285 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  39.31 
 
 
285 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 
236 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  27.12 
 
 
290 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  26.78 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  26.71 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  27.12 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  27.05 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  33.48 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  27.83 
 
 
290 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  27.83 
 
 
290 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  37.38 
 
 
298 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  26.78 
 
 
290 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.62 
 
 
317 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  32.72 
 
 
226 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  33.33 
 
 
312 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  34.21 
 
 
264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  33.92 
 
 
340 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  34.76 
 
 
317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  30.99 
 
 
233 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  31.05 
 
 
308 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  33.18 
 
 
232 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
371 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 
232 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 
232 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  34.21 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.28 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  36.76 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  30.71 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  29.86 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  30.32 
 
 
285 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  32.46 
 
 
232 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  31.14 
 
 
273 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  32.14 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.08 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.98 
 
 
292 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  32.89 
 
 
338 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.58 
 
 
312 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  31.05 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  30.92 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  30.92 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  33.64 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.76 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  30.23 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  29.47 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  29.22 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  29.06 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  31.34 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  33.05 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  32.4 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  33.05 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  33.05 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  34.16 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  29.26 
 
 
228 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  32.86 
 
 
300 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  36.74 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  32.09 
 
 
232 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  29.59 
 
 
287 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 
283 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  30.24 
 
 
286 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  26.69 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  33.82 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.48 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  33.77 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  30.9 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  27.35 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  29.07 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  32.86 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  31.16 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  30.88 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3169  ABC transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.386052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  26.45 
 
 
289 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3286  ABC transporter-related protein  32.6 
 
 
250 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.874938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  28.89 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>