More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2228 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  100 
 
 
287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  52.13 
 
 
294 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  48.62 
 
 
295 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  44.84 
 
 
309 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  43.82 
 
 
291 aa  231  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  47.58 
 
 
296 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  43.31 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  42.29 
 
 
283 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  35.29 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  35.48 
 
 
233 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  32.03 
 
 
273 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  29.82 
 
 
299 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  32.16 
 
 
287 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  29.35 
 
 
293 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  29.69 
 
 
293 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  30.66 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  33.64 
 
 
280 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  30.04 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  34.67 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  34.67 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  34.67 
 
 
287 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  29.25 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
287 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  31.6 
 
 
232 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.92 
 
 
292 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  39.34 
 
 
299 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  31.46 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  35.78 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  37.44 
 
 
280 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  32.89 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  32.59 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  33.78 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  29.6 
 
 
290 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  39.05 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  39.05 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  32.89 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 
290 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 
290 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 
290 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  28.96 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 
290 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 
290 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  41.18 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  38.5 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  28.51 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  32.44 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  32.44 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  32.44 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.42 
 
 
302 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 
290 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  28.7 
 
 
290 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  29.37 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  33.57 
 
 
290 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  29.86 
 
 
296 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  30.99 
 
 
228 aa  125  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  37.84 
 
 
756 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  31.94 
 
 
233 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  39.02 
 
 
301 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  37.02 
 
 
308 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  35.05 
 
 
316 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  29.37 
 
 
321 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  33.18 
 
 
306 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  31.92 
 
 
232 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 
233 aa  123  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  33.33 
 
 
316 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  33.33 
 
 
316 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  32.26 
 
 
316 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  29.3 
 
 
258 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  30.7 
 
 
327 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  37.28 
 
 
254 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 
301 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  27.83 
 
 
232 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  32.2 
 
 
299 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  32.41 
 
 
302 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  27.35 
 
 
290 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  34.4 
 
 
308 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  30.29 
 
 
300 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  37.5 
 
 
298 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 
300 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  31.53 
 
 
264 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  25.95 
 
 
293 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  32.54 
 
 
293 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 
283 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  30.29 
 
 
300 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  30.71 
 
 
326 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  31.66 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  28.1 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  31.96 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.94 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  28.1 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  34.08 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>