More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2970 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  100 
 
 
283 aa  578  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3904  ABC transporter related  55.86 
 
 
292 aa  308  9e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0282216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  55.4 
 
 
282 aa  295  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  46.81 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  44.48 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  44.13 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 
290 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
290 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
290 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
290 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
290 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  43.77 
 
 
290 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  43.77 
 
 
290 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
290 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  44.17 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  43.11 
 
 
306 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2508  ABC transporter related  46.44 
 
 
296 aa  231  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 
282 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  40.77 
 
 
288 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  42.31 
 
 
287 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
287 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0192  ABC transporter related  42.86 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
290 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
290 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  42.25 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  37.93 
 
 
292 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 
288 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  37.46 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  37.46 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  43.12 
 
 
302 aa  195  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
289 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  35.71 
 
 
280 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  35.71 
 
 
280 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  37.61 
 
 
298 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  38.07 
 
 
291 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0066  ABC transporter related  29.11 
 
 
308 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  35.27 
 
 
287 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  35.27 
 
 
287 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  35.27 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  36.73 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  33.46 
 
 
299 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.33 
 
 
293 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.86 
 
 
293 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  32.16 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  35.81 
 
 
287 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  35.32 
 
 
289 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  31.8 
 
 
287 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  31.8 
 
 
287 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  33.89 
 
 
283 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  31.8 
 
 
287 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  35.37 
 
 
265 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
305 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  36.91 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  34.36 
 
 
280 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  36.74 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  35.21 
 
 
310 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  35.4 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  29.57 
 
 
330 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
300 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  34.42 
 
 
299 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  34.19 
 
 
297 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  33.58 
 
 
313 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  34.47 
 
 
319 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  34.36 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  31.39 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.69 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  31.76 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  31.06 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
314 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
295 aa  127  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  31.54 
 
 
307 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  32.37 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  33.87 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  33.96 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 
307 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  33.82 
 
 
290 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  30.42 
 
 
390 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 
284 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  33.79 
 
 
326 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  38.21 
 
 
246 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  32.09 
 
 
373 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0764  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
249 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000201929  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  33.18 
 
 
302 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  35.87 
 
 
327 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  33.33 
 
 
284 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.12 
 
 
305 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  32.93 
 
 
327 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  31.56 
 
 
326 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
293 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>