More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0450 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  49.11 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  48.19 
 
 		 283 aa  295  8e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 283 aa  291  7e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  49.11 
 
 		 291 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  48.01 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 291 aa  285  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  39.16 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  40.21 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  37.08 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 232 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 		 232 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  36.53 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  34.09 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  33.05 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  35.16 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 236 aa  143  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  32.31 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  32.86 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  31.8 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  34.29 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  36.24 
 
 		 230 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  33.33 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  35.4 
 
 		 307 aa  128  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  32.02 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  32.02 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  29.41 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  32.31 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  31.93 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.8 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.78 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 232 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  33.01 
 
 		 233 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  30.17 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  31.47 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  28.51 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  31.38 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  32.19 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  27.6 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  30.03 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  27.95 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  29.3 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  31.2 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  28.72 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.69 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  32.19 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  31.51 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  27.91 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  27.31 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  29.33 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  29.68 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  34.42 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  28.37 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  31.51 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  29.26 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  30.17 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  30.54 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  30.47 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  30.56 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  30.34 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  27.4 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  30.52 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  34.08 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  27.08 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  29.09 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0208  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  27.45 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  27.06 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  27.45 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>