More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1132 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  55.56 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  55.56 
 
 		 264 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  52.71 
 
 		 273 aa  271  7e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  35.81 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  34.77 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.12 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  34.4 
 
 		 339 aa  139  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  34.96 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  35.32 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.5 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  32.86 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  35.5 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  38.18 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  33.33 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  33.78 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  37.56 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  31.78 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  31.16 
 
 		 307 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 300 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.08 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  37.5 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  31.82 
 
 		 341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  30 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  31.33 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  32.09 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  32.73 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  33.33 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.42 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  30.3 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  32.19 
 
 		 284 aa  128  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 390 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 310 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.79 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.18 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  31.48 
 
 		 317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.95 
 
 		 302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  35.14 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  29.39 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  29.78 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  29.39 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.7 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  33.19 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  37.34 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  33.64 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 327 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  32.51 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  34.8 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  34.47 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.28 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 		 300 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  33.03 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  38.91 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  31.16 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  32.55 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.77 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  34.95 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  29.26 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  31.63 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  30 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  29.86 
 
 		 741 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  30.88 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 		 299 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  33.63 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  31.63 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  31.31 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8858  ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 309 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  32.43 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>