More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0539 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  50.91 
 
 
284 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  48.53 
 
 
268 aa  291  7e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  50.56 
 
 
265 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  45.93 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  36 
 
 
264 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  36 
 
 
264 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  33.95 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  32.62 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  31.05 
 
 
290 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  38.39 
 
 
282 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 
283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  33.86 
 
 
286 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  35.02 
 
 
293 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 
290 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 
288 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 
288 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  34.88 
 
 
273 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
293 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  34.82 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  33.94 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  36.32 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  31.69 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  34.56 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  34.56 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
287 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  29.5 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  35 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  33.49 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  32.56 
 
 
291 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  29.75 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  32.19 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  36.92 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  31.54 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.44 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26165  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 
287 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  31.15 
 
 
287 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  31.92 
 
 
287 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.6 
 
 
310 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  33.18 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  31.92 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.63 
 
 
293 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.42 
 
 
302 aa  125  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  31.87 
 
 
302 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  30.47 
 
 
287 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  29.91 
 
 
299 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  30.08 
 
 
287 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  34.69 
 
 
298 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 
308 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  30.28 
 
 
306 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  31.36 
 
 
234 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  30.47 
 
 
287 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  30.7 
 
 
299 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
283 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
309 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  29.75 
 
 
297 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  30.04 
 
 
283 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
304 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  30.08 
 
 
287 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  29 
 
 
318 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2222  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0568841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  32.88 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  30.07 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  33.64 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  32.13 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  31.22 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  31.82 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  31.44 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  29.46 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.88 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  31.17 
 
 
346 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.44 
 
 
293 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  27.35 
 
 
299 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  30.58 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  28.85 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  31.51 
 
 
230 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  29.41 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  29.68 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
290 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>