More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1383 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  100 
 
 
288 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  57.45 
 
 
290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  56.23 
 
 
290 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
290 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
290 aa  346  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
290 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  54.45 
 
 
290 aa  345  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  54.45 
 
 
290 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  54.45 
 
 
290 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  54.45 
 
 
290 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  53.74 
 
 
290 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
287 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  52.65 
 
 
287 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
290 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
290 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
290 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
290 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
290 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
290 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  46.48 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  47.18 
 
 
282 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  44.21 
 
 
286 aa  258  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  41.37 
 
 
298 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  41.37 
 
 
298 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
283 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  44.13 
 
 
306 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3904  ABC transporter related  37.59 
 
 
292 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0282216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  35.84 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
289 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
283 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2508  ABC transporter related  41.89 
 
 
296 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  41.74 
 
 
302 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0192  ABC transporter related  32.64 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  38.89 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  36.44 
 
 
291 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  37.39 
 
 
284 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.68 
 
 
293 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.96 
 
 
293 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  38.76 
 
 
309 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 
284 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
340 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  35.58 
 
 
280 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  35.58 
 
 
280 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.24 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.74 
 
 
293 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  35.59 
 
 
265 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0066  ABC transporter related  31.84 
 
 
308 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  34.39 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  30.66 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  35.89 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  33.49 
 
 
287 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.32 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  34.68 
 
 
232 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  32.62 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.74 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  33.94 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  32.11 
 
 
280 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  35.89 
 
 
298 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  32.88 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  31.79 
 
 
307 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  33.63 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  32.29 
 
 
287 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  31.84 
 
 
297 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  33.94 
 
 
287 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  31.3 
 
 
280 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.78 
 
 
306 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  32.19 
 
 
296 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  31.84 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  32.42 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  34.84 
 
 
232 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  34.72 
 
 
306 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  33.48 
 
 
287 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  35.55 
 
 
247 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  30.61 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  31.25 
 
 
268 aa  135  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  36.24 
 
 
313 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  36.24 
 
 
313 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  36.24 
 
 
313 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  31.03 
 
 
299 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.48 
 
 
305 aa  135  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  30.94 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  32.26 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  32.86 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.88 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  31.56 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>