More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0161 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  99.62 
 
 
264 aa  523  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  55.56 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  53.38 
 
 
273 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
340 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  39.07 
 
 
302 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  37.33 
 
 
308 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  36.82 
 
 
274 aa  158  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  36 
 
 
284 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  36 
 
 
308 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  36.74 
 
 
308 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  35.65 
 
 
297 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  37.21 
 
 
309 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  31.34 
 
 
298 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.21 
 
 
302 aa  151  8.999999999999999e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  35.91 
 
 
293 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  35.35 
 
 
317 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  31.91 
 
 
306 aa  148  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  32.29 
 
 
268 aa  148  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  36.11 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  34.07 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  31.83 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  36.57 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.62 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.15 
 
 
337 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  33.33 
 
 
247 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  35.85 
 
 
306 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
341 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  36.15 
 
 
232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 
233 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  39.91 
 
 
237 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  36.57 
 
 
302 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  32.87 
 
 
306 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.65 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
266 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.74 
 
 
319 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  34.58 
 
 
232 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  35.65 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  35.65 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  35.65 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  33.04 
 
 
300 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.49 
 
 
317 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.4 
 
 
293 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
282 aa  142  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
332 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  36.28 
 
 
265 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 
307 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  34.07 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  35.51 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  38.26 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  35.89 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  35.78 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.4 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  33.8 
 
 
304 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  32.24 
 
 
306 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  31.85 
 
 
290 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.37 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  33.48 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  35.29 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  33.8 
 
 
307 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  37.67 
 
 
257 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  36.87 
 
 
313 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 
299 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.58 
 
 
305 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  37.56 
 
 
326 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.83 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.89 
 
 
301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  33.02 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  32.87 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 
311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.5 
 
 
312 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  33.64 
 
 
339 aa  136  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  30.9 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  29.93 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  29.93 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.74 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  32.46 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  40.18 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
314 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  28.78 
 
 
291 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  32.63 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  35.43 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.35 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  35.35 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.41 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.45 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>