More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1355 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  48.53 
 
 
284 aa  291  6e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  49.03 
 
 
265 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  48.33 
 
 
274 aa  273  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  45.93 
 
 
284 aa  268  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  35.81 
 
 
258 aa  152  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  34.36 
 
 
299 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  32.29 
 
 
264 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  32.29 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
293 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  34.8 
 
 
299 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 
293 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 
293 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 
290 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
290 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 
290 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  33.48 
 
 
290 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
290 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  34.88 
 
 
299 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
293 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
290 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
293 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 
293 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 
293 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
290 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
290 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  35.37 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
290 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  34.22 
 
 
273 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  36 
 
 
287 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
287 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  31.25 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.16 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  33.18 
 
 
240 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 
282 aa  132  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  31.96 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  28.76 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  31.71 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  30 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 
283 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  28.4 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  29.09 
 
 
234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  31.67 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  31.75 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  29.54 
 
 
302 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  28.51 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  25.56 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  30.32 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  34.67 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 
284 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  30.77 
 
 
244 aa  125  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  30.24 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  28.51 
 
 
287 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  33.81 
 
 
231 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  28.45 
 
 
340 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  28.63 
 
 
309 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  32.14 
 
 
282 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  30.24 
 
 
305 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 
249 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 
253 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  28.51 
 
 
287 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
253 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  27.47 
 
 
307 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  27.47 
 
 
307 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  31.82 
 
 
286 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  30.31 
 
 
286 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  28 
 
 
287 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  31.98 
 
 
239 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.07 
 
 
302 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  27.85 
 
 
297 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  30.58 
 
 
309 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  26.94 
 
 
323 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  34.13 
 
 
303 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0214  ABC transporter related  33.33 
 
 
234 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  29.61 
 
 
308 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.94 
 
 
308 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.64 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  30.94 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  28.19 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  32.6 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  32.04 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  30.84 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 
288 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  27.78 
 
 
253 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 
288 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  26.92 
 
 
307 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  28.44 
 
 
307 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  27.27 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  29.13 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.44 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  30.37 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  29.76 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.94 
 
 
253 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>