More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2243 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  38.33 
 
 
273 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  36.04 
 
 
293 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  36.04 
 
 
293 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  34.96 
 
 
299 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  36.28 
 
 
264 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  35.91 
 
 
264 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  34.07 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
304 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  31.42 
 
 
299 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  32.47 
 
 
306 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  34.72 
 
 
305 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  32.19 
 
 
340 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
308 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  34.86 
 
 
299 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  33.18 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  36.12 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  31.93 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  35.57 
 
 
307 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  35.57 
 
 
307 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  32.87 
 
 
300 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  33.18 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  33.18 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  33.18 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  31.97 
 
 
299 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  33.85 
 
 
309 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  31.09 
 
 
309 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  31.98 
 
 
301 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  33.77 
 
 
302 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  32.11 
 
 
308 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.13 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  30.52 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  31.63 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  35.05 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  30.56 
 
 
305 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  34.26 
 
 
339 aa  136  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  33.46 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  29.41 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  39 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  33.85 
 
 
300 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  30.2 
 
 
299 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  34.69 
 
 
291 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  29.9 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  30.36 
 
 
309 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  32.27 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  29.11 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  36.99 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  37.96 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  31.94 
 
 
306 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  31.19 
 
 
308 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  37.27 
 
 
298 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  33.03 
 
 
297 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 
293 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  36.08 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.09 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  35.89 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  30.86 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  31.96 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  30.09 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  29.15 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  31.63 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 
311 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  29.77 
 
 
323 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  28.43 
 
 
326 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  33.8 
 
 
312 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  32.64 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  35.6 
 
 
321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.47 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  29.31 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.88 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  32 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  32.26 
 
 
232 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  31.28 
 
 
316 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  31.08 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  31.74 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  37.56 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  31.75 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
310 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  33.62 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  30.83 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  29.13 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.99 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
293 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 
308 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  31.6 
 
 
302 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  30.56 
 
 
305 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  33.8 
 
 
232 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  31.3 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  33.33 
 
 
288 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
293 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  31.65 
 
 
285 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  29.63 
 
 
307 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  32.32 
 
 
328 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>