More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0428 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  52.71 
 
 
258 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  53.38 
 
 
264 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  53.38 
 
 
264 aa  269  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  37.08 
 
 
293 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  37.08 
 
 
293 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.33 
 
 
293 aa  155  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 
290 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  35.65 
 
 
309 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.27 
 
 
339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  34.98 
 
 
290 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  35.81 
 
 
247 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  36.24 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  36.24 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  36.24 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
290 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
287 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
290 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
290 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  34.65 
 
 
232 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.7 
 
 
302 aa  142  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  34.27 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  37.67 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  33.18 
 
 
306 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 
290 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 
309 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  32.09 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  35.27 
 
 
313 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  39.64 
 
 
299 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
288 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
327 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 
311 aa  139  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  33.63 
 
 
288 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  34.48 
 
 
233 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  31.48 
 
 
305 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  34.22 
 
 
268 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  32.26 
 
 
317 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  39.32 
 
 
287 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  33.18 
 
 
300 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  35.75 
 
 
321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.16 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.87 
 
 
284 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  36.09 
 
 
337 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  31.58 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  39.64 
 
 
313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  33.8 
 
 
232 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  36.75 
 
 
240 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  30.17 
 
 
308 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  34.86 
 
 
302 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
341 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  35.09 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.27 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  34.88 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  33.49 
 
 
390 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  33.18 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.62 
 
 
304 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  29.74 
 
 
308 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  35.24 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  33.33 
 
 
302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
293 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  30.08 
 
 
306 aa  132  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  34.25 
 
 
298 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  31.97 
 
 
319 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  31.65 
 
 
301 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  31.48 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  30.65 
 
 
274 aa  131  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.35 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  31.82 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  29.43 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  33.64 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  34.82 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  32.76 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  36.67 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.21 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.41 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  33.62 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  32.56 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  37.87 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  34.25 
 
 
284 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>