More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0223 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  49.65 
 
 
306 aa  299  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  47.14 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  47.14 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  46.79 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
290 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
290 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
290 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  46.07 
 
 
290 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  46.48 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  46.32 
 
 
287 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
287 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
282 aa  250  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  45.96 
 
 
286 aa  244  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  45.55 
 
 
282 aa  241  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
290 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
290 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
290 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
290 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
290 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3904  ABC transporter related  41.78 
 
 
292 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0282216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  39.22 
 
 
298 aa  215  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  39.22 
 
 
298 aa  215  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 
288 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 
288 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
304 aa  208  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2508  ABC transporter related  43.03 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0192  ABC transporter related  39.64 
 
 
288 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 
283 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 
283 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  35.69 
 
 
292 aa  185  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 
289 aa  182  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  39.91 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  38.05 
 
 
298 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0066  ABC transporter related  27.21 
 
 
308 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  34.46 
 
 
280 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  34.46 
 
 
280 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  37.93 
 
 
291 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  37.07 
 
 
293 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  37.56 
 
 
293 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
309 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  36.36 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
340 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  32.74 
 
 
265 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  30.85 
 
 
317 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  33.86 
 
 
284 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  30.49 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  34.41 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  33.48 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  33.33 
 
 
306 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  32.88 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.15 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 
300 aa  132  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  37.16 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  32.74 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1068  ABC transporter related  35.53 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  30.51 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.94 
 
 
302 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  29.69 
 
 
304 aa  132  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.63 
 
 
299 aa  132  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  30.9 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  35.47 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  31.42 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  32.74 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  32.76 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  35.29 
 
 
303 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
305 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  32.54 
 
 
319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.64 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.48 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1514  ABC transporter related  37.63 
 
 
205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
247 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.04 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  35.43 
 
 
255 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  30.91 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  31.86 
 
 
308 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  30.08 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  34.23 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  31.74 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  32.43 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  25.93 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  32.26 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.13 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  32.2 
 
 
280 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
297 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  32.26 
 
 
287 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.87 
 
 
317 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>