More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0451 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0696  ABC transporter related  42.86 
 
 
252 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225842  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  39.29 
 
 
298 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  42.4 
 
 
290 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
241 aa  156  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  38.25 
 
 
297 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
241 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  34.93 
 
 
255 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
241 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
241 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
248 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
241 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 
297 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  34.03 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
241 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 
297 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 
248 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  36.41 
 
 
291 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  38.29 
 
 
302 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
253 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  34.63 
 
 
241 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
309 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
293 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  35 
 
 
306 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
297 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  34.95 
 
 
318 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 
297 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
297 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 
297 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
297 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 
244 aa  148  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  35.16 
 
 
293 aa  148  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  32.62 
 
 
583 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 
308 aa  148  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  31.74 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  34.47 
 
 
318 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  32.43 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.5 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  33.5 
 
 
318 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
297 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
300 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  38.07 
 
 
286 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  35.37 
 
 
270 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  33.62 
 
 
302 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  32.77 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.48 
 
 
302 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  32.2 
 
 
284 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 
306 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  32.77 
 
 
244 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.19 
 
 
303 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  31.08 
 
 
328 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  32.21 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  32.77 
 
 
244 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.93 
 
 
279 aa  144  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
252 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
246 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  36.87 
 
 
293 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  36.87 
 
 
293 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  32.58 
 
 
302 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  34.8 
 
 
580 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  33.8 
 
 
300 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  32.77 
 
 
244 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
580 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
578 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 
307 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
578 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
578 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  35.14 
 
 
295 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
578 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  32.35 
 
 
244 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  40.28 
 
 
247 aa  142  4e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  36.4 
 
 
258 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  32.61 
 
 
248 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
585 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
309 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  31.67 
 
 
305 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
222 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
222 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
578 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  38.43 
 
 
291 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  31.51 
 
 
244 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  31.51 
 
 
244 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  34.84 
 
 
299 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  33.48 
 
 
298 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  35.94 
 
 
290 aa  141  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  35.71 
 
 
246 aa  141  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  35.71 
 
 
246 aa  141  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  32.35 
 
 
244 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  29.73 
 
 
337 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 
314 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  34.08 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  35.87 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.43 
 
 
302 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  31.51 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  31.51 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>