More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000966 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  88.42 
 
 		 285 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  69.23 
 
 		 236 aa  315  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 277 aa  234  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  39.15 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  39.31 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  39.31 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  30.68 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  35.45 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  33.5 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  32.52 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  28.64 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  31.1 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  32.2 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 		 233 aa  122  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  32.59 
 
 		 232 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  30.52 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  29.28 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  30.38 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  30.08 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  29.68 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  33 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  28.45 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  27.52 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  30.28 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  32.31 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  31 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  33.63 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.51 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  28.51 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  27.54 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2218  methyltransferase  31.03 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.301934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  32.69 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  30.28 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  30.67 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  27.46 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  33.01 
 
 		 236 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  28.44 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  28.7 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.91 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  29.59 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  27.4 
 
 		 232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  27.98 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.99 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  30.94 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  29.64 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  26.88 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.29 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  27.56 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  28.97 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  35.78 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  33.33 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  30.29 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  29.66 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  27.86 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  30.45 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  27.86 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 		 232 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  30.18 
 
 		 316 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  28.64 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  28.64 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1564  ABC transporter related  32.39 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239809  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  32.73 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  31.19 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  35.24 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  32.52 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  29.9 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  30.04 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  32.03 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  34.6 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  32.21 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  29 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>