More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
322 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  58.42 
 
 
308 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  50.69 
 
 
292 aa  278  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  52.86 
 
 
335 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  54.55 
 
 
294 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  44.25 
 
 
290 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  47.62 
 
 
289 aa  252  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  44.33 
 
 
304 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.42 
 
 
292 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  43.96 
 
 
316 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  45.49 
 
 
285 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.91 
 
 
302 aa  205  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  37.59 
 
 
288 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  38.97 
 
 
299 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
308 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  37.96 
 
 
290 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  46.58 
 
 
295 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  40 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  34.19 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  37.54 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
290 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
290 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  33.22 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.53 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  35.87 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
238 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.7 
 
 
245 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  41.75 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  32.97 
 
 
288 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  34.31 
 
 
287 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  33.07 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  31.74 
 
 
309 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.65 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  26.76 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  31.78 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  32.02 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  26.37 
 
 
293 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  29.27 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  30.84 
 
 
299 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  34.86 
 
 
232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  28.77 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  26.94 
 
 
298 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  25 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  31.5 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  30.24 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  27.68 
 
 
297 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  24.56 
 
 
298 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  24.56 
 
 
298 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  30.54 
 
 
291 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  34.43 
 
 
297 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  32.46 
 
 
287 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  25.7 
 
 
299 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 
283 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
283 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  35.14 
 
 
295 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  24.91 
 
 
291 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  29.29 
 
 
295 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  32.52 
 
 
301 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  25.7 
 
 
293 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 
291 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  35.4 
 
 
309 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  27.02 
 
 
293 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  30.32 
 
 
232 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  29.87 
 
 
308 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  29.13 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  28.5 
 
 
232 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  30.41 
 
 
291 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  30.41 
 
 
232 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.25 
 
 
309 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
232 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  29.56 
 
 
296 aa  99  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  32.18 
 
 
309 aa  99  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 
293 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  26.17 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  26.98 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
232 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  31.1 
 
 
236 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  30.69 
 
 
233 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
232 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  30.21 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 
232 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  30.3 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  30.21 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 
232 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 
232 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 
232 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  36.36 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  30.69 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  34.31 
 
 
226 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
232 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  32 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  29.59 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  32 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  30.13 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>