More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2608 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  57.09 
 
 
288 aa  337  9e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  49.47 
 
 
287 aa  279  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  45.58 
 
 
287 aa  262  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.43 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  42.81 
 
 
290 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
304 aa  228  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  40.28 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  38.46 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.56 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
308 aa  215  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  42.31 
 
 
290 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.94 
 
 
292 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  45.78 
 
 
238 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  36.75 
 
 
290 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  38.55 
 
 
299 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  38.08 
 
 
308 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  35.46 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  37.32 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  36.46 
 
 
297 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.54 
 
 
322 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  34.07 
 
 
288 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  37.73 
 
 
304 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  33.92 
 
 
294 aa  171  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
335 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  32.14 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.96 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  35.48 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  35.68 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  35.29 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  34.84 
 
 
232 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.07 
 
 
293 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  34.68 
 
 
232 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  35.05 
 
 
299 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 
236 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  28.27 
 
 
291 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
232 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
232 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  35.75 
 
 
234 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  27.82 
 
 
299 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  36.97 
 
 
228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  31.48 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.15 
 
 
284 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  28.63 
 
 
299 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  28.38 
 
 
285 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  32.75 
 
 
233 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  32.23 
 
 
232 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  31.63 
 
 
296 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  28.64 
 
 
285 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 
291 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  31.71 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  33.62 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  27.24 
 
 
283 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  27.24 
 
 
283 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  32.21 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  30.56 
 
 
226 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  29.11 
 
 
299 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.41 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  36.92 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  33.82 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
285 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 
293 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  28.4 
 
 
299 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  26.79 
 
 
280 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 
293 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  32.34 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  26.36 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  26.91 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  33 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
299 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 
293 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  30.83 
 
 
293 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
312 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  34.17 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
293 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
293 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 
293 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>