More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0948 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  71.49 
 
 		 285 aa  323  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  69.23 
 
 		 285 aa  315  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 285 aa  214  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  42.2 
 
 		 291 aa  204  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 		 291 aa  204  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  40.18 
 
 		 283 aa  200  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 283 aa  200  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  40.55 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  39.63 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  31.19 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  32.55 
 
 		 299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  32.69 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  31.9 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  31.94 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  32.58 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  30.77 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  27.85 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  33.91 
 
 		 356 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  31.22 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.82 
 
 		 302 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.82 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  30.09 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  32.22 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  31.1 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  31.11 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  26.03 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  29.22 
 
 		 316 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.96 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  29.95 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  31.65 
 
 		 338 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  33.18 
 
 		 290 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  31.05 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  31.63 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  31.63 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  29.69 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  32.71 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  31.78 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  27.6 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  34.12 
 
 		 306 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  33.04 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  27.35 
 
 		 292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  35.5 
 
 		 360 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.62 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  30.62 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  31.06 
 
 		 325 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1305  ABC transporter-related protein  29.82 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000307697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  26.7 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.26 
 
 		 293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  33.04 
 
 		 309 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  30.61 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  33.19 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  28.7 
 
 		 288 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  32.16 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  30.71 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.22 
 
 		 302 aa  108  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 305 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  33.04 
 
 		 301 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  31.62 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1722  methionine import ATP-binding protein MetN  29.09 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0576  ABC transporter related  31.4 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490377  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2218  methyltransferase  28.23 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.301934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  31.28 
 
 		 311 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  27.16 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  31.34 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  31.9 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  33.63 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  26.36 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  30.41 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  32.62 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>