More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
292 aa  587  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  55.63 
 
 
316 aa  318  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.98 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  51.54 
 
 
304 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  55.28 
 
 
285 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  51.71 
 
 
299 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  51.43 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  44.95 
 
 
289 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
301 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  43.32 
 
 
288 aa  231  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.45 
 
 
322 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  37.89 
 
 
283 aa  209  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 
290 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
290 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
290 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  40 
 
 
290 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  37.46 
 
 
290 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.95 
 
 
290 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  39.45 
 
 
297 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  34.51 
 
 
288 aa  188  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  41.84 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  36.71 
 
 
287 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  41.99 
 
 
335 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  33.8 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  33.57 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  40.28 
 
 
295 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  31.6 
 
 
291 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  33.18 
 
 
299 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
287 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 
283 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 
277 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  29.51 
 
 
291 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  33.77 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  29.8 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  29.44 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.67 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
297 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  27.94 
 
 
299 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.11 
 
 
293 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  25.52 
 
 
299 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  29.43 
 
 
292 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  35.09 
 
 
226 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.03 
 
 
293 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  32.72 
 
 
280 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  25.91 
 
 
299 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.09 
 
 
232 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  30.43 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 
236 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  28.9 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0794  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  33.64 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  30.88 
 
 
295 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  30.23 
 
 
233 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  35.11 
 
 
281 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  27.98 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  32.2 
 
 
234 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  28.51 
 
 
233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  31.58 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 
285 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  25.85 
 
 
299 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  31.31 
 
 
308 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  29.28 
 
 
286 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  30.23 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  31.94 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  32.02 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  26.99 
 
 
290 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 
290 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  29.82 
 
 
287 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  29.83 
 
 
306 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  32.45 
 
 
263 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  26.6 
 
 
293 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 
232 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  32.41 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  32.86 
 
 
301 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 
232 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  26.55 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  26.55 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  26.55 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  26.55 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  34.09 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  26.99 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  26.55 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  31.92 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  27.93 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  34.09 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  30.99 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  32.06 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>