More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1344 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  100 
 
 		 309 aa  613  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  50.17 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  50.35 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  51.61 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  44.21 
 
 		 281 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  44.37 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  36.03 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  37.23 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  30.91 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  33.78 
 
 		 232 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  30.87 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  34.88 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  41.63 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  35.07 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  34.9 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  28.3 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  34.88 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  34.88 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  34.88 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  33.49 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  28.1 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  27.35 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  35.94 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  27.62 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  28.12 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.57 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  27.62 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  36.97 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  36.97 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  29.91 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  29.91 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  27.62 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  29.49 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1447  ABC transporter related  37.21 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.292722  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  33.94 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  36.84 
 
 		 904 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  33.94 
 
 		 280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  36.7 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  37.85 
 
 		 909 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  36.49 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  38.39 
 
 		 593 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  34.16 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  29.52 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.59 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  31.56 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  32.6 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  34.29 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  34.29 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  28.77 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  35.71 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  34.93 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  37.84 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  39.55 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  30.88 
 
 		 234 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  31.53 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  31.53 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  31.53 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.63 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.25 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  37.32 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.74 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  31.53 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.82 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  33.65 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  28 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  38.89 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  28.04 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  35.29 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  30.73 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  34.82 
 
 		 576 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  37.44 
 
 		 741 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  36.17 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  37.29 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  32.3 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  33.33 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>