More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2570 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  100 
 
 
292 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  56.74 
 
 
289 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  50 
 
 
290 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  54.7 
 
 
308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.69 
 
 
322 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  52.63 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  53.26 
 
 
335 aa  269  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  47.59 
 
 
316 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
304 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.2 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  42.59 
 
 
299 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.64 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  45.8 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
308 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  43.06 
 
 
285 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
301 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 
290 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 
290 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  38.93 
 
 
288 aa  208  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  39.78 
 
 
290 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 
290 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.57 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  35.46 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  34.98 
 
 
297 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  36.55 
 
 
288 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  34.75 
 
 
304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  34.52 
 
 
287 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 
238 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  35.19 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  32.38 
 
 
291 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  28.84 
 
 
232 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  31.93 
 
 
296 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  26.92 
 
 
299 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  34.56 
 
 
291 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 
283 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  30.47 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  28.38 
 
 
233 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  30.18 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  29.33 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  29.33 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
232 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  27.35 
 
 
236 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  26.94 
 
 
297 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
232 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  29.3 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
232 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
232 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
232 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  26.6 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  35.55 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  32.37 
 
 
233 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  25 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  31.25 
 
 
232 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  26.12 
 
 
301 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  32.13 
 
 
340 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  31.58 
 
 
230 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  29.15 
 
 
315 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  27.68 
 
 
285 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  29.86 
 
 
232 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  27.57 
 
 
299 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  27.31 
 
 
227 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  33.79 
 
 
328 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  32.02 
 
 
319 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  31.88 
 
 
331 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 
285 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  28.7 
 
 
233 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  27.52 
 
 
275 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  26.36 
 
 
292 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  29.72 
 
 
232 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  32.07 
 
 
312 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  25.96 
 
 
236 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  31.67 
 
 
317 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  30.24 
 
 
234 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.78 
 
 
344 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  28.19 
 
 
281 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  30.28 
 
 
293 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  28.44 
 
 
305 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  30.13 
 
 
308 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
293 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  26.73 
 
 
302 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  29.38 
 
 
309 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  32.72 
 
 
309 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  24.73 
 
 
299 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  34.12 
 
 
320 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  24.83 
 
 
295 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.88 
 
 
312 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  34.12 
 
 
320 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 
294 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.48 
 
 
310 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>