More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
245 aa  473  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
308 aa  188  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.7 
 
 
322 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  47.22 
 
 
294 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  42.79 
 
 
289 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  39 
 
 
292 aa  164  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  42.59 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  38.32 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.28 
 
 
302 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
308 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  38.05 
 
 
316 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  37.56 
 
 
304 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  36.56 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  32.38 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  32.86 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  31.31 
 
 
299 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  30 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  30.05 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.53 
 
 
292 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 
290 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  28.04 
 
 
299 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  32.08 
 
 
287 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  29.26 
 
 
290 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  29.47 
 
 
299 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.68 
 
 
290 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  32.46 
 
 
287 aa  118  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  32.54 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  26.85 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  28.44 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  31.34 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 
293 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  32.2 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 
294 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  33.64 
 
 
233 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  32.8 
 
 
293 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 
293 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  29.03 
 
 
228 aa  111  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  30.28 
 
 
232 aa  111  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  31.42 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
303 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  30.35 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  27 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  30.56 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  26.21 
 
 
299 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
299 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  29.77 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  35.71 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
293 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 
293 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  29.95 
 
 
291 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  27.6 
 
 
232 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 
293 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 
293 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  38.5 
 
 
330 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  30.09 
 
 
287 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  31.73 
 
 
298 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  34.08 
 
 
309 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  27.31 
 
 
284 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
287 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  31.28 
 
 
302 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  35.29 
 
 
253 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  37.33 
 
 
295 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
297 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  26.89 
 
 
243 aa  105  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.36 
 
 
306 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 
232 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  25.33 
 
 
291 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 
293 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  37.67 
 
 
328 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  28.37 
 
 
280 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 
307 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
308 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  32.73 
 
 
287 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  28.7 
 
 
232 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  25.23 
 
 
234 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  28.57 
 
 
265 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  30.41 
 
 
232 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.45 
 
 
307 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  28.09 
 
 
232 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  28.37 
 
 
232 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  27.78 
 
 
313 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  33.92 
 
 
247 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  32.82 
 
 
302 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 
232 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  28.25 
 
 
236 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  32.55 
 
 
281 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  35.62 
 
 
329 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  29.46 
 
 
296 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  24.42 
 
 
268 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>