112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2177 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  63.16 
 
 		 608 aa  755    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  66.32 
 
 		 585 aa  771    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  64.77 
 
 		 600 aa  761    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  68.98 
 
 		 590 aa  796    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  100 
 
 		 582 aa  1175    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  39.74 
 
 		 615 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  41.23 
 
 		 626 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  39.56 
 
 		 566 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  36.16 
 
 		 546 aa  307  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  35.17 
 
 		 541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  34.78 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  37.42 
 
 		 546 aa  296  9e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  31.35 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  30.94 
 
 		 538 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  28.96 
 
 		 538 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  30.62 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  30.28 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  29.03 
 
 		 602 aa  190  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  29.05 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.59 
 
 		 649 aa  97.4  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.84 
 
 		 495 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.42 
 
 		 483 aa  91.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.94 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.53 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  21.24 
 
 		 652 aa  87  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  25 
 
 		 543 aa  86.7  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.94 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.57 
 
 		 649 aa  84.3  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.45 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.28 
 
 		 649 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.1 
 
 		 649 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.81 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.71 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.63 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.46 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  23.08 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.67 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.11 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.63 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  24.13 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.08 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.44 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.6 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  38.1 
 
 		 152 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  22.11 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.83 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  33.79 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  37.16 
 
 		 633 aa  57  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  35.57 
 
 		 184 aa  57  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  35.86 
 
 		 166 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.99 
 
 		 380 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.99 
 
 		 380 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  27.7 
 
 		 227 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  35.33 
 
 		 155 aa  53.5  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  35.46 
 
 		 159 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  35.26 
 
 		 161 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.48 
 
 		 378 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.13 
 
 		 371 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.13 
 
 		 371 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  35.29 
 
 		 176 aa  51.6  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  34.69 
 
 		 153 aa  50.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.67 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  35.57 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.74 
 
 		 395 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  31.29 
 
 		 382 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.09 
 
 		 367 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  23 
 
 		 379 aa  47.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0600679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  30 
 
 		 156 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1506  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.35 
 
 		 385 aa  47.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.966603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2957  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.74 
 
 		 383 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.22 
 
 		 580 aa  47  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2713  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.26 
 
 		 383 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  39.68 
 
 		 201 aa  47  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  31.78 
 
 		 217 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.88 
 
 		 400 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 		 677 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.93 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1789  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.35 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320337  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  34.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.16 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.89 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.33 
 
 		 379 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.33 
 
 		 379 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.46 
 
 		 367 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.38 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.88 
 
 		 374 aa  45.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  25.57 
 
 		 371 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>