38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2206 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  100 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  59.09 
 
 
160 aa  200  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  53.33 
 
 
155 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  51.37 
 
 
164 aa  161  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  48.32 
 
 
184 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  46.58 
 
 
159 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  48 
 
 
166 aa  138  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  44 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  38.67 
 
 
606 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  41.51 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  40.38 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  36.73 
 
 
172 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  37.93 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  32.24 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  31.54 
 
 
652 aa  85.9  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  37.24 
 
 
161 aa  83.6  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.33 
 
 
649 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.73 
 
 
649 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.38 
 
 
649 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.7 
 
 
649 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  31.72 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  30.87 
 
 
615 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  34.27 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  32.37 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  27.86 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  28.15 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  33.78 
 
 
566 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  32.45 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  25.74 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  31.13 
 
 
626 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  48 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  28.57 
 
 
600 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.62 
 
 
608 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.62 
 
 
585 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30 
 
 
582 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  25.17 
 
 
472 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  28.93 
 
 
590 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  31.01 
 
 
544 aa  43.9  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>