More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1632 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  67.38 
 
 
652 aa  919    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
649 aa  1332    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  95.99 
 
 
649 aa  1292    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  82.72 
 
 
649 aa  1144    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  97.38 
 
 
649 aa  1303    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.49 
 
 
606 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  48 
 
 
483 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  45.27 
 
 
489 aa  399  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  44.75 
 
 
489 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  45.89 
 
 
491 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  44.11 
 
 
500 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  44.59 
 
 
491 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.3 
 
 
484 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.08 
 
 
482 aa  359  7e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.92 
 
 
483 aa  359  9e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  40.78 
 
 
543 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.51 
 
 
489 aa  350  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.75 
 
 
481 aa  349  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  38.45 
 
 
507 aa  317  6e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.29 
 
 
495 aa  298  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.2 
 
 
494 aa  298  2e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.42 
 
 
494 aa  296  8e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.73 
 
 
495 aa  294  4e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.95 
 
 
503 aa  291  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.28 
 
 
498 aa  276  8e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.77 
 
 
522 aa  251  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  26.98 
 
 
344 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.71 
 
 
362 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.41 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.77 
 
 
369 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.97 
 
 
371 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.97 
 
 
371 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.37 
 
 
377 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.84 
 
 
373 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.52 
 
 
370 aa  126  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.34 
 
 
376 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  28 
 
 
375 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.98 
 
 
384 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.9 
 
 
367 aa  125  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.27 
 
 
336 aa  125  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.46 
 
 
388 aa  124  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 
375 aa  124  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.01 
 
 
394 aa  124  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
367 aa  123  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.89 
 
 
369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.47 
 
 
368 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.89 
 
 
369 aa  122  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.48 
 
 
368 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.17 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.97 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.48 
 
 
370 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
374 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.48 
 
 
391 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.25 
 
 
376 aa  120  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
374 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.45 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.23 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.78 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.05 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.18 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.04 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.78 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.2 
 
 
368 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.78 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.78 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.78 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.91 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.5 
 
 
387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.68 
 
 
372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.37 
 
 
374 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.55 
 
 
379 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 
387 aa  119  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.55 
 
 
379 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
377 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.55 
 
 
380 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.46 
 
 
381 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.65 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  43.33 
 
 
159 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.37 
 
 
372 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.45 
 
 
371 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
375 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
381 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 
377 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.76 
 
 
379 aa  117  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.27 
 
 
379 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.27 
 
 
379 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.27 
 
 
379 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.27 
 
 
379 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.27 
 
 
379 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>