More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1831 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  61.25 
 
 
481 aa  641    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  70.83 
 
 
483 aa  699    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
484 aa  993    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  69.16 
 
 
482 aa  666    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  64.67 
 
 
489 aa  658    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
483 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  52.01 
 
 
490 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  50.22 
 
 
476 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  51.04 
 
 
491 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  50 
 
 
491 aa  440  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 
489 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  46.94 
 
 
500 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.93 
 
 
489 aa  428  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.51 
 
 
649 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.3 
 
 
649 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.88 
 
 
652 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.88 
 
 
649 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.3 
 
 
649 aa  366  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  39.29 
 
 
606 aa  326  6e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  39.16 
 
 
543 aa  296  6e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  33.48 
 
 
507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.69 
 
 
498 aa  270  4e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.12 
 
 
503 aa  259  8e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.26 
 
 
494 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.05 
 
 
495 aa  240  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.24 
 
 
495 aa  231  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.99 
 
 
522 aa  229  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  31.45 
 
 
344 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.2 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.5 
 
 
375 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.2 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  27 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.08 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.07 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.37 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.93 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.67 
 
 
397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.13 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.07 
 
 
395 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.87 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.48 
 
 
370 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.33 
 
 
395 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 
397 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.61 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
370 aa  113  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.68 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.8 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.8 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.39 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.8 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.63 
 
 
370 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.54 
 
 
396 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 
376 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.8 
 
 
400 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.4 
 
 
372 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.17 
 
 
387 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.11 
 
 
387 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.89 
 
 
367 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 
370 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.62 
 
 
373 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.24 
 
 
373 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 
381 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.5 
 
 
362 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.23 
 
 
375 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.21 
 
 
373 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.91 
 
 
373 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.48 
 
 
375 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
375 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  24.66 
 
 
382 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.48 
 
 
375 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.48 
 
 
375 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.76 
 
 
372 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.48 
 
 
375 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.42 
 
 
391 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  27 
 
 
376 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.48 
 
 
370 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 
376 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.74 
 
 
371 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.93 
 
 
371 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.93 
 
 
371 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.1 
 
 
382 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 
381 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.91 
 
 
371 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
374 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
374 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
374 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.93 
 
 
369 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.46 
 
 
376 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.66 
 
 
378 aa  103  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.35 
 
 
384 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.83 
 
 
381 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.93 
 
 
375 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>