More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1434 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  65.13 
 
 
500 aa  655    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
489 aa  991    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  70.67 
 
 
491 aa  679    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  70.06 
 
 
491 aa  696    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  66.8 
 
 
489 aa  633  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  53.42 
 
 
490 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
483 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  50.86 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.77 
 
 
489 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.93 
 
 
484 aa  428  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.07 
 
 
481 aa  422  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.6 
 
 
483 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  46.6 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  43.62 
 
 
652 aa  404  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  44.75 
 
 
649 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  45.47 
 
 
649 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.01 
 
 
649 aa  389  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  43.42 
 
 
649 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  42.15 
 
 
606 aa  345  8e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  41.6 
 
 
543 aa  292  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.68 
 
 
498 aa  272  8.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  34.45 
 
 
507 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.93 
 
 
503 aa  263  6e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.43 
 
 
495 aa  259  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.61 
 
 
494 aa  256  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.56 
 
 
494 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.4 
 
 
495 aa  248  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.48 
 
 
522 aa  232  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  28.27 
 
 
344 aa  136  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.86 
 
 
380 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.14 
 
 
370 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 
367 aa  124  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.38 
 
 
384 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.08 
 
 
377 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.55 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.08 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.05 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.93 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.34 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.26 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.18 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.14 
 
 
388 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.11 
 
 
371 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.38 
 
 
391 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.21 
 
 
407 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.47 
 
 
362 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.4 
 
 
395 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.91 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.92 
 
 
375 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.57 
 
 
381 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.62 
 
 
377 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.14 
 
 
369 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.37 
 
 
369 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.38 
 
 
376 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.18 
 
 
377 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.18 
 
 
377 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.48 
 
 
373 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.14 
 
 
371 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.35 
 
 
375 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.14 
 
 
388 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.83 
 
 
368 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  28.84 
 
 
371 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.14 
 
 
376 aa  104  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.89 
 
 
380 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.65 
 
 
371 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.57 
 
 
368 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.48 
 
 
370 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.48 
 
 
382 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.38 
 
 
367 aa  103  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
369 aa  103  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.61 
 
 
380 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.61 
 
 
380 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
369 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.82 
 
 
381 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 
371 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.49 
 
 
371 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.68 
 
 
384 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.49 
 
 
371 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.58 
 
 
379 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.27 
 
 
373 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.17 
 
 
377 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  27 
 
 
372 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2176  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.65 
 
 
383 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.53 
 
 
372 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.53 
 
 
373 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 
379 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.95 
 
 
374 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.18 
 
 
355 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.5 
 
 
372 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.3 
 
 
394 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1091  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.21 
 
 
377 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.4 
 
 
368 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.02 
 
 
380 aa  100  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.3 
 
 
388 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.1 
 
 
373 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  26.43 
 
 
382 aa  100  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.18 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1052  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.93 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.13 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.67 
 
 
373 aa  99.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>