More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2518 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.83 
 
 
379 aa  721    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  94.47 
 
 
380 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.83 
 
 
379 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.83 
 
 
379 aa  721    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.83 
 
 
379 aa  721    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.83 
 
 
379 aa  721    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.83 
 
 
379 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.83 
 
 
379 aa  721    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  88.1 
 
 
379 aa  721    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.3 
 
 
379 aa  718    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.57 
 
 
379 aa  719    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
380 aa  794    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  87.57 
 
 
379 aa  719    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.47 
 
 
379 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.47 
 
 
379 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.4 
 
 
379 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.21 
 
 
380 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.21 
 
 
380 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.15 
 
 
382 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.89 
 
 
373 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.16 
 
 
374 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.2 
 
 
375 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.22 
 
 
372 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.57 
 
 
373 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.2 
 
 
379 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.31 
 
 
370 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.78 
 
 
373 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
369 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.2 
 
 
370 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  57.79 
 
 
406 aa  488  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.27 
 
 
372 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.41 
 
 
357 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.55 
 
 
370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.47 
 
 
369 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.4 
 
 
371 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
384 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.81 
 
 
372 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.58 
 
 
373 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.53 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.6 
 
 
387 aa  457  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1289  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  60.52 
 
 
347 aa  457  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.74 
 
 
368 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.24 
 
 
367 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.13 
 
 
372 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 
369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.01 
 
 
368 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 
384 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
368 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.01 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.73 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.23 
 
 
380 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.51 
 
 
392 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.92 
 
 
374 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.91 
 
 
375 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  55.65 
 
 
382 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.81 
 
 
377 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.64 
 
 
387 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.81 
 
 
377 aa  428  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.57 
 
 
368 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.18 
 
 
387 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.71 
 
 
379 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
394 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.87 
 
 
379 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.1 
 
 
381 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.91 
 
 
387 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.96 
 
 
378 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 
381 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 
366 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.57 
 
 
368 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.56 
 
 
372 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.56 
 
 
384 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 
374 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.84 
 
 
374 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.84 
 
 
374 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 
366 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.84 
 
 
395 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.84 
 
 
374 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.77 
 
 
375 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 
374 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
374 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.81 
 
 
355 aa  421  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.38 
 
 
374 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.38 
 
 
374 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.3 
 
 
374 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.84 
 
 
381 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.23 
 
 
394 aa  421  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.76 
 
 
382 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.03 
 
 
374 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.38 
 
 
374 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.3 
 
 
374 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.76 
 
 
377 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.3 
 
 
374 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
375 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>