More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1231 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 369 aa  760    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.73 
 
 		 369 aa  759    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.24 
 
 		 367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 		 373 aa  440  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.11 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.79 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.05 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.34 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.24 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.7 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.21 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.69 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.56 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.68 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.51 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.11 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.27 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.64 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.9 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.38 
 
 		 374 aa  378  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.55 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.69 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.13 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.69 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.96 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 380 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 		 370 aa  371  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.54 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.84 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.35 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.89 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  50 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.27 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.57 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.98 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.84 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.18 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>