More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1606 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
388 aa  797    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.47 
 
 
375 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.49 
 
 
373 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.65 
 
 
369 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.56 
 
 
372 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.01 
 
 
380 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.74 
 
 
380 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
369 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
374 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
394 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
370 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.1 
 
 
379 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.18 
 
 
357 aa  428  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.1 
 
 
379 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.74 
 
 
379 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.66 
 
 
372 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.53 
 
 
373 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.75 
 
 
370 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.53 
 
 
373 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
370 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.99 
 
 
379 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
379 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.72 
 
 
379 aa  418  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
379 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 
371 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.49 
 
 
373 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
392 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 
372 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  52 
 
 
392 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.93 
 
 
370 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.9 
 
 
377 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.66 
 
 
372 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 
392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
367 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.37 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
380 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.57 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 
395 aa  398  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.92 
 
 
376 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.99 
 
 
386 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
369 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
383 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
382 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 
375 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 
383 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
367 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 
380 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
355 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
383 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.65 
 
 
368 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
374 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 
375 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
385 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
368 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 
376 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
368 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.26 
 
 
379 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.79 
 
 
378 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
380 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
377 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
377 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  50.79 
 
 
382 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
374 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
377 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.27 
 
 
336 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.28 
 
 
376 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
387 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
368 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
377 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 
387 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
374 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
374 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.57 
 
 
374 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
375 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  51.07 
 
 
375 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
371 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
375 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.55 
 
 
374 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
374 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
375 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
374 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 
374 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.55 
 
 
374 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
375 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>