More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0396 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
380 aa  800    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  85.45 
 
 
382 aa  685    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  90.53 
 
 
380 aa  741    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.33 
 
 
379 aa  610  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.06 
 
 
379 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.8 
 
 
379 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.8 
 
 
379 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.8 
 
 
379 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.8 
 
 
379 aa  608  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.8 
 
 
379 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.8 
 
 
379 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.8 
 
 
379 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.53 
 
 
379 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.53 
 
 
379 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.21 
 
 
380 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.88 
 
 
380 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.09 
 
 
379 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.09 
 
 
379 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.76 
 
 
379 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.67 
 
 
374 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.67 
 
 
375 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
373 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.5 
 
 
373 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.23 
 
 
372 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.89 
 
 
372 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  59.95 
 
 
406 aa  497  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.81 
 
 
370 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.43 
 
 
373 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.66 
 
 
369 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.18 
 
 
379 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1289  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  63.56 
 
 
347 aa  475  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.65 
 
 
370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.87 
 
 
367 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.95 
 
 
384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
371 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.63 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.7 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.25 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
373 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.97 
 
 
372 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
369 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 
357 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
368 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.3 
 
 
368 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 
369 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
372 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.86 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.49 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 
374 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.86 
 
 
370 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.11 
 
 
392 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.73 
 
 
379 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.84 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
380 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
377 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
381 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
392 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
392 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.16 
 
 
355 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 
377 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
380 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
382 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.36 
 
 
381 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
372 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  50.82 
 
 
382 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.67 
 
 
380 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.67 
 
 
380 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
387 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.55 
 
 
377 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.08 
 
 
336 aa  388  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
366 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
387 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.36 
 
 
381 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
379 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.82 
 
 
371 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
375 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
366 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 
387 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 
383 aa  391  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.39 
 
 
376 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.83 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
373 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.82 
 
 
395 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.56 
 
 
407 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.99 
 
 
377 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 
376 aa  387  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.86 
 
 
377 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
374 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
374 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
374 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 
373 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>