More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0052 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 392 aa  821    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  99.23 
 
 		 392 aa  813    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  94.39 
 
 		 392 aa  786    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.63 
 
 		 375 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.25 
 
 		 373 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.13 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.2 
 
 		 370 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 		 372 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.28 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.17 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.93 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 		 372 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.44 
 
 		 379 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.44 
 
 		 379 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.61 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.61 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.76 
 
 		 374 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.57 
 
 		 373 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.92 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.26 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 		 380 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.49 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.97 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.66 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.33 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.55 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.72 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.11 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.65 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.53 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.54 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.96 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.3 
 
 		 383 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.93 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  49.59 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.1 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.71 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.86 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 		 394 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.93 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.78 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.14 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.71 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.75 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0466  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  49 
 
 		 678 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 		 384 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  49.59 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>