More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1275 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
336 aa  686    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.92 
 
 
369 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.24 
 
 
370 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.17 
 
 
372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.76 
 
 
373 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.93 
 
 
375 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.26 
 
 
369 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.24 
 
 
373 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.5 
 
 
373 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.82 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.44 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.19 
 
 
374 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
372 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.74 
 
 
380 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.44 
 
 
373 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.36 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
379 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.36 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.36 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.36 
 
 
379 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.59 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.62 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.94 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.36 
 
 
379 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.36 
 
 
379 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.33 
 
 
370 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.26 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.2 
 
 
379 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.04 
 
 
384 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.77 
 
 
371 aa  394  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 
392 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.59 
 
 
392 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.59 
 
 
380 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.49 
 
 
382 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 
380 aa  392  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.82 
 
 
368 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.08 
 
 
380 aa  388  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.49 
 
 
372 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
355 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.79 
 
 
371 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.89 
 
 
368 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 
392 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 
372 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.99 
 
 
375 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 
372 aa  384  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.22 
 
 
368 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.22 
 
 
368 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.59 
 
 
368 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.57 
 
 
372 aa  384  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.73 
 
 
385 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.27 
 
 
388 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.62 
 
 
377 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.26 
 
 
384 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.42 
 
 
367 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 
369 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.43 
 
 
370 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.05 
 
 
375 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.12 
 
 
365 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.18 
 
 
374 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  56 
 
 
386 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.71 
 
 
387 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.71 
 
 
381 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.69 
 
 
407 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
377 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.82 
 
 
374 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.99 
 
 
380 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.29 
 
 
376 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.82 
 
 
385 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.73 
 
 
395 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 
381 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.82 
 
 
377 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.43 
 
 
376 aa  371  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
379 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.38 
 
 
377 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.43 
 
 
376 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.82 
 
 
367 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
374 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
374 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 
378 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
374 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.17 
 
 
380 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.85 
 
 
377 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.87 
 
 
375 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.95 
 
 
394 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.82 
 
 
374 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.35 
 
 
391 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 
374 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 
376 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
374 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.52 
 
 
387 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 
387 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.82 
 
 
374 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>