More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1120 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
369 aa  766    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.72 
 
 
370 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.38 
 
 
372 aa  551  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.21 
 
 
375 aa  551  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.14 
 
 
372 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.49 
 
 
373 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.21 
 
 
379 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.94 
 
 
374 aa  527  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.4 
 
 
379 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.4 
 
 
379 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.74 
 
 
373 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
373 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.22 
 
 
379 aa  511  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
380 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.67 
 
 
379 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.57 
 
 
380 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.67 
 
 
379 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 
379 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.25 
 
 
370 aa  498  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.15 
 
 
357 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.71 
 
 
370 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.66 
 
 
380 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.5 
 
 
371 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.88 
 
 
373 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.56 
 
 
369 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.38 
 
 
380 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  60 
 
 
372 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.9 
 
 
368 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.78 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.97 
 
 
384 aa  465  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.92 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.65 
 
 
388 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.01 
 
 
372 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.99 
 
 
368 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.01 
 
 
372 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.3 
 
 
368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.71 
 
 
368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.79 
 
 
392 aa  451  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
368 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.99 
 
 
367 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.08 
 
 
371 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.24 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.08 
 
 
371 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.3 
 
 
355 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.82 
 
 
380 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.25 
 
 
392 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.07 
 
 
394 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 
392 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
369 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.87 
 
 
370 aa  431  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.16 
 
 
392 aa  431  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.7 
 
 
379 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.77 
 
 
370 aa  428  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.32 
 
 
395 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 
374 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.23 
 
 
385 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
380 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.95 
 
 
373 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 
373 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.4 
 
 
367 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
372 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.05 
 
 
391 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.1 
 
 
370 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.34 
 
 
385 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
379 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  54.25 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 
374 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 
374 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
376 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1506  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
385 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.966603 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 
374 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
371 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
371 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
376 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1789  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
393 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.96 
 
 
377 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 
377 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
370 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 
387 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.9 
 
 
371 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 
377 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 
381 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
365 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.59 
 
 
383 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.22 
 
 
376 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.5 
 
 
381 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.97 
 
 
387 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.57 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>