More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1756 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.65 
 
 
376 aa  635    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.12 
 
 
377 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.05 
 
 
379 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
377 aa  787    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  82.93 
 
 
377 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.81 
 
 
377 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.34 
 
 
379 aa  591  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.1 
 
 
376 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.87 
 
 
375 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.03 
 
 
373 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.67 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.35 
 
 
376 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.66 
 
 
370 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 
376 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
376 aa  408  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 
369 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 
376 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.64 
 
 
376 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.01 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
380 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
380 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
374 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
372 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 
376 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 
379 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
372 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  51.48 
 
 
376 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
372 aa  401  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.22 
 
 
376 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
380 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.61 
 
 
370 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
370 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.54 
 
 
371 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
395 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
373 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.31 
 
 
379 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 
387 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
371 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.35 
 
 
407 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
379 aa  391  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.99 
 
 
355 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 
367 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
357 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.67 
 
 
384 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
377 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 
373 aa  381  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.37 
 
 
374 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 
368 aa  378  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 
380 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 
380 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
392 aa  375  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
386 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 
377 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.11 
 
 
372 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
372 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
367 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 
380 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
375 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
382 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.61 
 
 
365 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.52 
 
 
369 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.11 
 
 
392 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 
394 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 
381 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.73 
 
 
392 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
375 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 
378 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.11 
 
 
375 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
379 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.12 
 
 
374 aa  373  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 
376 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
376 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 
374 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 
381 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
371 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.25 
 
 
374 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.75 
 
 
392 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
379 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 
373 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.07 
 
 
388 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.93 
 
 
378 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.28 
 
 
368 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1307  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
387 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>