More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0033 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  78.79 
 
 
494 aa  817    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  73.36 
 
 
495 aa  736    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
495 aa  1002    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  75.15 
 
 
494 aa  799    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  46.27 
 
 
522 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  43.91 
 
 
543 aa  367  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  43.14 
 
 
503 aa  333  5e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.81 
 
 
498 aa  329  7e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.63 
 
 
649 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.39 
 
 
652 aa  300  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  37.17 
 
 
507 aa  296  5e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.91 
 
 
649 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.73 
 
 
649 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.12 
 
 
476 aa  294  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.73 
 
 
649 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.42 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.08 
 
 
489 aa  262  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.28 
 
 
490 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.4 
 
 
489 aa  248  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.19 
 
 
481 aa  247  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.55 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  34.3 
 
 
606 aa  244  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.64 
 
 
500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.42 
 
 
482 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.21 
 
 
491 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.26 
 
 
491 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.24 
 
 
484 aa  231  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.83 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  27.01 
 
 
344 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.17 
 
 
392 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.87 
 
 
370 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.93 
 
 
377 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.56 
 
 
374 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.91 
 
 
371 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.91 
 
 
371 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.93 
 
 
372 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
381 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
374 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.97 
 
 
370 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
374 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
374 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
392 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.76 
 
 
372 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
381 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
392 aa  104  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.65 
 
 
371 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.82 
 
 
377 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.48 
 
 
375 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.28 
 
 
379 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.28 
 
 
379 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.82 
 
 
371 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.7 
 
 
379 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.65 
 
 
377 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.82 
 
 
377 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.96 
 
 
368 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.65 
 
 
377 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.73 
 
 
375 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.03 
 
 
368 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
377 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.69 
 
 
387 aa  101  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.35 
 
 
381 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.04 
 
 
387 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.27 
 
 
362 aa  100  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.86 
 
 
369 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.79 
 
 
370 aa  100  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.15 
 
 
380 aa  99  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
368 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.78 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.34 
 
 
374 aa  98.2  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.14 
 
 
374 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.97 
 
 
384 aa  97.8  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.69 
 
 
368 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.8 
 
 
370 aa  97.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.97 
 
 
377 aa  97.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.82 
 
 
379 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  28.99 
 
 
371 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.37 
 
 
367 aa  97.1  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.04 
 
 
372 aa  97.1  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 
373 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.68 
 
 
367 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.67 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.14 
 
 
380 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.79 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>