46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2533 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  100 
 
 
159 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  63.46 
 
 
184 aa  190  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  63.06 
 
 
166 aa  187  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  59.46 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  57.04 
 
 
155 aa  163  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  54.79 
 
 
152 aa  158  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  46.58 
 
 
156 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  44.14 
 
 
606 aa  127  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  46.01 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  43.87 
 
 
164 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  43.33 
 
 
649 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.33 
 
 
649 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  49.3 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.61 
 
 
649 aa  114  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.29 
 
 
649 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.91 
 
 
652 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  36.76 
 
 
189 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  40.56 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  41.1 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.65 
 
 
626 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  35.17 
 
 
615 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  34.46 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  34.29 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  37.25 
 
 
600 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  32.39 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  32.35 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.17 
 
 
585 aa  57.4  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  30.82 
 
 
157 aa  57.4  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  37.5 
 
 
633 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  35.95 
 
 
566 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  33.09 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  30.32 
 
 
634 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.46 
 
 
582 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.46 
 
 
608 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  44.3 
 
 
546 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  40.91 
 
 
544 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  48.05 
 
 
541 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  47.3 
 
 
546 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  34.93 
 
 
590 aa  47.4  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.1 
 
 
580 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  36.49 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  38.24 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  30.26 
 
 
376 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  37.25 
 
 
60 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  29.49 
 
 
481 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>