More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1313 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
482 aa  989    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  69.16 
 
 
484 aa  666    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  62.58 
 
 
481 aa  652    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  65.42 
 
 
483 aa  637    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  61.64 
 
 
489 aa  615  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  52.87 
 
 
490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  51.39 
 
 
476 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.67 
 
 
483 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.68 
 
 
489 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  46.39 
 
 
491 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  46.6 
 
 
489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  45.59 
 
 
500 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  48.06 
 
 
491 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.15 
 
 
652 aa  362  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.54 
 
 
649 aa  360  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.08 
 
 
649 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.33 
 
 
649 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.67 
 
 
649 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  41.08 
 
 
606 aa  331  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  39.6 
 
 
543 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.48 
 
 
498 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.61 
 
 
503 aa  249  7e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  32.92 
 
 
507 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.42 
 
 
495 aa  239  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.5 
 
 
522 aa  236  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.33 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.49 
 
 
495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.14 
 
 
494 aa  230  5e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  31.75 
 
 
344 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.99 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.73 
 
 
370 aa  123  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.81 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.1 
 
 
370 aa  116  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.97 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
377 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.38 
 
 
386 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
388 aa  113  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.52 
 
 
374 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.52 
 
 
374 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.52 
 
 
374 aa  113  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.35 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.03 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.98 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
367 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 
369 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
381 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
375 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
375 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
375 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
375 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.74 
 
 
375 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.08 
 
 
380 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  27 
 
 
395 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 
375 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.05 
 
 
373 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.9 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.48 
 
 
370 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.37 
 
 
373 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 
370 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.83 
 
 
377 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.75 
 
 
370 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.58 
 
 
372 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.04 
 
 
371 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.76 
 
 
376 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  25.75 
 
 
382 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.7 
 
 
388 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.45 
 
 
371 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.03 
 
 
374 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.05 
 
 
372 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.25 
 
 
370 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 
376 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.47 
 
 
379 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
375 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.95 
 
 
373 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
374 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.76 
 
 
371 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
379 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.76 
 
 
377 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.76 
 
 
377 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  27.79 
 
 
371 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.79 
 
 
377 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.12 
 
 
375 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 
384 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 
376 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>