More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1287 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  70.83 
 
 
484 aa  699    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  62.5 
 
 
481 aa  638    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  62.83 
 
 
489 aa  637    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  65.42 
 
 
482 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
483 aa  978    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  51.47 
 
 
490 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.89 
 
 
483 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  50.64 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  50.52 
 
 
491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  48.97 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  50.31 
 
 
491 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  50.11 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.6 
 
 
489 aa  415  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.22 
 
 
652 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.75 
 
 
649 aa  363  4e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.92 
 
 
649 aa  359  6e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.72 
 
 
649 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.72 
 
 
649 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.96 
 
 
606 aa  330  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  33.04 
 
 
507 aa  286  5e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  40.1 
 
 
543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.06 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.46 
 
 
503 aa  250  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.28 
 
 
494 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.5 
 
 
494 aa  240  4e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.4 
 
 
495 aa  228  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.89 
 
 
522 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.83 
 
 
495 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  31.68 
 
 
344 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.95 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.09 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.92 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.52 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.62 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.08 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.92 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.19 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.28 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.89 
 
 
369 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.93 
 
 
395 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 
375 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.47 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.87 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.37 
 
 
372 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.21 
 
 
372 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.95 
 
 
371 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.04 
 
 
367 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.38 
 
 
370 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.25 
 
 
371 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.25 
 
 
371 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.84 
 
 
372 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 
368 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  27 
 
 
376 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.36 
 
 
368 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.65 
 
 
368 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.57 
 
 
391 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.76 
 
 
404 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.03 
 
 
396 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.79 
 
 
373 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.27 
 
 
388 aa  106  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.42 
 
 
370 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.73 
 
 
375 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.53 
 
 
376 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.26 
 
 
382 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.06 
 
 
367 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.02 
 
 
381 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.17 
 
 
399 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
395 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.11 
 
 
387 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.75 
 
 
395 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.65 
 
 
372 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.25 
 
 
384 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.75 
 
 
395 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
395 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.2 
 
 
379 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.5 
 
 
374 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
447 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
370 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
397 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.05 
 
 
370 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.18 
 
 
377 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.86 
 
 
374 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.98 
 
 
377 aa  103  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.06 
 
 
379 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0600679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.85 
 
 
390 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
374 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.89 
 
 
355 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.34 
 
 
395 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
374 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
374 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.89 
 
 
373 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 
377 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
397 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
394 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
397 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.49 
 
 
379 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
397 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.15 
 
 
397 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.84 
 
 
373 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.49 
 
 
379 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>