More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1207 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  62.5 
 
 
483 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  61.25 
 
 
484 aa  641    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
481 aa  991    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  62.58 
 
 
482 aa  652    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  59.3 
 
 
489 aa  616  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.78 
 
 
483 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.57 
 
 
490 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.67 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.07 
 
 
489 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.62 
 
 
489 aa  424  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  46.12 
 
 
491 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
500 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  47.22 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.32 
 
 
652 aa  366  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.18 
 
 
649 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.96 
 
 
649 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.75 
 
 
649 aa  349  7e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.22 
 
 
649 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  42.53 
 
 
606 aa  338  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  38.54 
 
 
543 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  35.27 
 
 
507 aa  266  7e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.29 
 
 
494 aa  252  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.14 
 
 
495 aa  249  8e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.19 
 
 
498 aa  249  9e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.19 
 
 
495 aa  247  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.48 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.9 
 
 
522 aa  236  7e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.57 
 
 
503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  31.27 
 
 
344 aa  146  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.6 
 
 
367 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.86 
 
 
373 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.25 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
362 aa  110  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.7 
 
 
375 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0944  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.37 
 
 
378 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
372 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
395 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 
376 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.45 
 
 
376 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.35 
 
 
369 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.35 
 
 
369 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.69 
 
 
391 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.04 
 
 
370 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.61 
 
 
388 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 
370 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
384 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.73 
 
 
379 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.22 
 
 
371 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.51 
 
 
367 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
375 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
375 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.82 
 
 
372 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.2 
 
 
370 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
375 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
375 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
375 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.7 
 
 
372 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
375 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 
376 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.72 
 
 
377 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.28 
 
 
387 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
381 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.2 
 
 
381 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
387 aa  100  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.48 
 
 
373 aa  99.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.58 
 
 
377 aa  99.8  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.56 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.44 
 
 
377 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  24.73 
 
 
382 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 
371 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.44 
 
 
371 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.14 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.34 
 
 
383 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.14 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 
371 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.44 
 
 
377 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.14 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
370 aa  97.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
377 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.61 
 
 
383 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.2 
 
 
377 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.79 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  25.67 
 
 
371 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.27 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.07 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.18 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 
373 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.06 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.83 
 
 
382 aa  95.5  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>