40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2274 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  350  4e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  41.5 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  38.89 
 
 		 606 aa  99.4  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  36.73 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  40.56 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  37.84 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  38.82 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  38.89 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  43.15 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  38.78 
 
 		 152 aa  94.4  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  34.59 
 
 		 189 aa  90.9  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  34.69 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.88 
 
 		 649 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.14 
 
 		 649 aa  85.5  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  37.58 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  37.24 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.41 
 
 		 652 aa  84.3  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.43 
 
 		 649 aa  84  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.53 
 
 		 649 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  34.69 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  26.8 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.79 
 
 		 582 aa  63.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.87 
 
 		 585 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.47 
 
 		 608 aa  57.4  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  31.72 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  31.37 
 
 		 600 aa  55.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  32.28 
 
 		 566 aa  54.7  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  29.33 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  29.45 
 
 		 590 aa  50.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  32.89 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  26.62 
 
 		 626 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  34.92 
 
 		 633 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  32.48 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  32.14 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  25.87 
 
 		 602 aa  43.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  28.46 
 
 		 544 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  39.06 
 
 		 546 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  26.97 
 
 		 497 aa  42.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  32.88 
 
 		 634 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>