15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1534 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  48.2 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  42.36 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  43.26 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  38.24 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  33.82 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  29.33 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  26.75 
 
 		 606 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  25.74 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  24.11 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 		 649 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  29.91 
 
 		 472 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.35 
 
 		 649 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  32.26 
 
 		 539 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  27.35 
 
 		 633 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>