78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2157 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  64.77 
 
 
582 aa  761    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  65.28 
 
 
590 aa  758    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  66.35 
 
 
608 aa  805    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  70.78 
 
 
585 aa  839    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  100 
 
 
600 aa  1214    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  41.21 
 
 
615 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  39.57 
 
 
626 aa  422  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  39.27 
 
 
566 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  39.08 
 
 
544 aa  282  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  34.56 
 
 
541 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  33.84 
 
 
546 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  34.34 
 
 
546 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  32.72 
 
 
541 aa  253  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  29.49 
 
 
538 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  29.3 
 
 
538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  28.91 
 
 
538 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  27.8 
 
 
539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  25.49 
 
 
497 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  25.46 
 
 
602 aa  144  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.92 
 
 
652 aa  93.2  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.14 
 
 
649 aa  92  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.83 
 
 
649 aa  91.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 
490 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.05 
 
 
489 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.92 
 
 
500 aa  87.4  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  23.51 
 
 
606 aa  87  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.67 
 
 
649 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.28 
 
 
483 aa  84  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  20.61 
 
 
649 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.92 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.78 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  24.91 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  24.38 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.56 
 
 
495 aa  74.3  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  21.01 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.54 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.53 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.57 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.08 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.48 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.33 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.43 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  37.5 
 
 
176 aa  65.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  37.25 
 
 
159 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  37.66 
 
 
152 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  39.45 
 
 
633 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.01 
 
 
495 aa  57.4  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  33.76 
 
 
184 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.67 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  32.69 
 
 
155 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  31.37 
 
 
172 aa  55.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.08 
 
 
494 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  34.42 
 
 
166 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.68 
 
 
580 aa  51.6  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  38.18 
 
 
634 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  45.45 
 
 
161 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  33.67 
 
 
509 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  32.32 
 
 
227 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  31.53 
 
 
206 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  28.57 
 
 
156 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  32.05 
 
 
164 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  36.36 
 
 
159 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.72 
 
 
677 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  38.27 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  38.89 
 
 
159 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  35.06 
 
 
159 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 
380 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 
380 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  29.51 
 
 
228 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  36.11 
 
 
201 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  34.44 
 
 
153 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  35.06 
 
 
159 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  36.56 
 
 
189 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  44.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.34 
 
 
678 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  26.62 
 
 
160 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  38.71 
 
 
158 aa  43.5  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>