49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0694 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  310  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  53.33 
 
 
156 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  57.04 
 
 
159 aa  163  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  52.45 
 
 
160 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  53.52 
 
 
164 aa  149  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  51.3 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  47.02 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  52.82 
 
 
166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  42 
 
 
606 aa  118  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  43.06 
 
 
164 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  42.58 
 
 
176 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  40.69 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  39.19 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.56 
 
 
649 aa  90.9  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  34.69 
 
 
172 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  35.09 
 
 
189 aa  87  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.48 
 
 
649 aa  84  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.61 
 
 
649 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.61 
 
 
649 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
652 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  33.1 
 
 
615 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  35.54 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  32.12 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.57 
 
 
585 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  29.2 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  32.41 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  32.69 
 
 
600 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  27.46 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  52 
 
 
60 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  51.67 
 
 
546 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.33 
 
 
582 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  31.58 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.56 
 
 
608 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  53.33 
 
 
544 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  28.81 
 
 
633 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  33.33 
 
 
590 aa  51.2  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  32.64 
 
 
566 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  31.93 
 
 
634 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  46.67 
 
 
541 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  24.64 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  27.82 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  23.31 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  54.17 
 
 
546 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 
377 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  38.55 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  48.33 
 
 
541 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  24.31 
 
 
472 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  32.39 
 
 
376 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  38.71 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>