77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1772 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  56.21 
 
 
626 aa  739    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  100 
 
 
615 aa  1265    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  39.74 
 
 
582 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  41.21 
 
 
600 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  40.19 
 
 
590 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  42.3 
 
 
566 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  39.16 
 
 
585 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.3 
 
 
608 aa  398  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  38.79 
 
 
546 aa  345  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  36.95 
 
 
544 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  32.95 
 
 
541 aa  325  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  34.26 
 
 
546 aa  323  6e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  32.36 
 
 
541 aa  295  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  31.07 
 
 
539 aa  209  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  30.39 
 
 
538 aa  203  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  30.39 
 
 
538 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  29.48 
 
 
538 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  30.44 
 
 
497 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  28.84 
 
 
602 aa  186  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.7 
 
 
649 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  26.56 
 
 
543 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.8 
 
 
649 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.04 
 
 
483 aa  115  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.8 
 
 
649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.92 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.74 
 
 
652 aa  109  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  23.33 
 
 
606 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.69 
 
 
490 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.97 
 
 
491 aa  97.1  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.77 
 
 
476 aa  94.4  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.29 
 
 
483 aa  93.2  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  23.05 
 
 
507 aa  92.8  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.85 
 
 
495 aa  91.3  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.67 
 
 
489 aa  90.9  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.07 
 
 
484 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.69 
 
 
489 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 
481 aa  88.6  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.69 
 
 
491 aa  87.8  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.27 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.75 
 
 
500 aa  84  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.77 
 
 
495 aa  82  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  23.53 
 
 
503 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.52 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  37.34 
 
 
166 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.06 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.78 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  30.87 
 
 
156 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  35.17 
 
 
159 aa  67  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  26.8 
 
 
172 aa  65.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  33.1 
 
 
155 aa  65.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  34.25 
 
 
161 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  30.92 
 
 
184 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  63.9  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  29.02 
 
 
227 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  33.08 
 
 
201 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  27.4 
 
 
228 aa  57.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  28.97 
 
 
160 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1279  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.03 
 
 
252 aa  57  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  28.86 
 
 
164 aa  55.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  31.37 
 
 
176 aa  53.9  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  29.69 
 
 
206 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  29.63 
 
 
217 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.56 
 
 
580 aa  50.8  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  30.87 
 
 
164 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  40.85 
 
 
159 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  39.44 
 
 
159 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  37.97 
 
 
161 aa  47.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  39.56 
 
 
160 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  38.27 
 
 
159 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  39.44 
 
 
159 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  21.62 
 
 
522 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  32.38 
 
 
472 aa  46.6  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.97 
 
 
240 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  48.15 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  33.33 
 
 
633 aa  43.9  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>