68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1286 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  59.37 
 
 		 541 aa  663    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  61.17 
 
 		 546 aa  656    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1112    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  56.25 
 
 		 541 aa  598  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  53.31 
 
 		 546 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  36.95 
 
 		 615 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  35.63 
 
 		 626 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  40.88 
 
 		 566 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.78 
 
 		 582 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  39.08 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.08 
 
 		 585 aa  269  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.46 
 
 		 608 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  34.63 
 
 		 590 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  27.58 
 
 		 538 aa  193  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  31.38 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  29.69 
 
 		 538 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  29.13 
 
 		 538 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  30.5 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  27.37 
 
 		 602 aa  167  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.69 
 
 		 649 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  21.89 
 
 		 649 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  21.96 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  21.86 
 
 		 649 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.8 
 
 		 652 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.27 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.89 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  30.2 
 
 		 206 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  24.12 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  30.91 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.3 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.84 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  24.72 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.77 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  29.55 
 
 		 217 aa  57  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.4 
 
 		 484 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  24.2 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  26.32 
 
 		 228 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  34.91 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  53.33 
 
 		 155 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.67 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  40.91 
 
 		 159 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.27 
 
 		 240 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.61 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  48.15 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  43.84 
 
 		 184 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  44.44 
 
 		 151 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  31.82 
 
 		 633 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.14 
 
 		 580 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  19.59 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.21 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.61 
 
 		 494 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  26.61 
 
 		 227 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  36.49 
 
 		 159 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  36.36 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.85 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.27 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  35.14 
 
 		 159 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.29 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  35.14 
 
 		 159 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.61 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.73 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  39.29 
 
 		 377 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  31.01 
 
 		 156 aa  43.9  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  40 
 
 		 166 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  44.44 
 
 		 151 aa  43.5  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  36.49 
 
 		 159 aa  43.5  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>