40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2748 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  70.9 
 
 
164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  52 
 
 
153 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  50.58 
 
 
161 aa  154  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  45.99 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  36.02 
 
 
184 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  36.76 
 
 
159 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  36.57 
 
 
606 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  37.84 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  35.43 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  34.05 
 
 
172 aa  92.8  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  87.8  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  36.47 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  33.52 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.98 
 
 
649 aa  85.1  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  45.98 
 
 
652 aa  85.1  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  32.24 
 
 
156 aa  85.1  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  43.02 
 
 
649 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.7 
 
 
649 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.7 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  31.84 
 
 
566 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  31.2 
 
 
157 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  31.61 
 
 
590 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  31.96 
 
 
634 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  30.88 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  27.65 
 
 
615 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.65 
 
 
608 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.65 
 
 
585 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  30.81 
 
 
600 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  32.46 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.23 
 
 
582 aa  45.1  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  34.67 
 
 
469 aa  45.1  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  30.11 
 
 
633 aa  44.7  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.82 
 
 
580 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  32.43 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  32.56 
 
 
464 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  34.71 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  41.18 
 
 
60 aa  42.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  29.03 
 
 
602 aa  41.6  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  30.83 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>