83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1433 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  65.28 
 
 		 600 aa  781    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  100 
 
 		 590 aa  1191    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  68.98 
 
 		 582 aa  817    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  64.55 
 
 		 608 aa  765    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  66.39 
 
 		 585 aa  764    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  40.19 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 		 626 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  38.14 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  32.94 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  34.63 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  33.28 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  32.09 
 
 		 546 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  30.2 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  26.89 
 
 		 538 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  27.23 
 
 		 538 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  27.9 
 
 		 539 aa  177  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  26.72 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  26.61 
 
 		 602 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  27.66 
 
 		 497 aa  156  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.3 
 
 		 652 aa  99  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.67 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.7 
 
 		 490 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.67 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.33 
 
 		 649 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.17 
 
 		 649 aa  90.5  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.88 
 
 		 483 aa  90.1  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  24.62 
 
 		 507 aa  87.4  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.46 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.63 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.33 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.46 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.48 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.94 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  25.69 
 
 		 543 aa  77.8  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.72 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.75 
 
 		 498 aa  77  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.69 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.14 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  25.21 
 
 		 503 aa  73.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.41 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  24.07 
 
 		 606 aa  67  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.33 
 
 		 491 aa  67  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.89 
 
 		 495 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.78 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  36.42 
 
 		 161 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  34.64 
 
 		 153 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  35.71 
 
 		 176 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  31.4 
 
 		 189 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  50.8  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  30.51 
 
 		 227 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.08 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.08 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  29.45 
 
 		 172 aa  50.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  38.71 
 
 		 206 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  38.1 
 
 		 201 aa  47.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  33.71 
 
 		 217 aa  47.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  33.03 
 
 		 633 aa  47.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  47.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  34.93 
 
 		 159 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 		 580 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.37 
 
 		 371 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  35.33 
 
 		 166 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.12 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  30.82 
 
 		 152 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.83 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 		 380 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 		 380 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.6 
 
 		 379 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  28.93 
 
 		 156 aa  44.3  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  32.09 
 
 		 240 aa  43.5  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.83 
 
 		 378 aa  43.5  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>