32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0226 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  100 
 
 
153 aa  299  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  61.27 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  52 
 
 
189 aa  164  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  60.69 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  59.6 
 
 
176 aa  157  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  43.15 
 
 
164 aa  107  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  45.03 
 
 
184 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.27 
 
 
606 aa  100  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  45.89 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  37.93 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  40.69 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  37.75 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  41.1 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  37.24 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  36.67 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.65 
 
 
649 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.46 
 
 
649 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.67 
 
 
649 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  31.58 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.67 
 
 
649 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  31.58 
 
 
652 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  33.76 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  34.64 
 
 
590 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.69 
 
 
582 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  37.32 
 
 
566 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.48 
 
 
608 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  34.44 
 
 
600 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.76 
 
 
585 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  30.99 
 
 
152 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  28.87 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  31.2 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  28.57 
 
 
149 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>