77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1661 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  100 
 
 
566 aa  1136    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  43.86 
 
 
626 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  42.3 
 
 
615 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  39.56 
 
 
582 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  39.27 
 
 
600 aa  329  9e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  38.31 
 
 
590 aa  318  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.86 
 
 
585 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  41.14 
 
 
546 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  36.35 
 
 
546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.47 
 
 
608 aa  306  9.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  40.88 
 
 
544 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  38.45 
 
 
541 aa  296  9e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  34.27 
 
 
541 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  31.32 
 
 
538 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  31.11 
 
 
538 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  30.69 
 
 
538 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  32.27 
 
 
497 aa  184  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  29.08 
 
 
539 aa  180  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  27.13 
 
 
602 aa  157  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  24.79 
 
 
606 aa  96.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.33 
 
 
481 aa  87.8  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.18 
 
 
649 aa  87.8  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  26.41 
 
 
543 aa  87.4  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  22.54 
 
 
507 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  21.9 
 
 
649 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.79 
 
 
649 aa  84  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.82 
 
 
652 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.69 
 
 
490 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.59 
 
 
483 aa  82  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.37 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.06 
 
 
649 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.53 
 
 
476 aa  76.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.55 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.32 
 
 
484 aa  73.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.98 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.95 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.38 
 
 
495 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.65 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  25 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.47 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  20.92 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.21 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
494 aa  66.6  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  37.42 
 
 
184 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.1 
 
 
494 aa  61.6  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.61 
 
 
489 aa  61.2  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  27.93 
 
 
219 aa  60.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.73 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  33.78 
 
 
156 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.65 
 
 
240 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  30.83 
 
 
217 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  35.95 
 
 
159 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  32.24 
 
 
164 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  29.29 
 
 
206 aa  55.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  36.91 
 
 
166 aa  55.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  32.28 
 
 
172 aa  54.7  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  35.62 
 
 
164 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  30.43 
 
 
201 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  34.29 
 
 
228 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  32.91 
 
 
176 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  38.03 
 
 
227 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  31.28 
 
 
189 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  39.77 
 
 
633 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1279  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.44 
 
 
252 aa  50.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  32.65 
 
 
160 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  40.74 
 
 
161 aa  50.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  32.64 
 
 
155 aa  50.4  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  37.37 
 
 
159 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  37.37 
 
 
159 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  37.32 
 
 
153 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  39.39 
 
 
159 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  39.33 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  32.65 
 
 
161 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  37.37 
 
 
159 aa  47  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  34.48 
 
 
158 aa  45.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  35.14 
 
 
161 aa  44.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>